Waterschap Peel en Maasvallei gebruikt voor haar beheer en onderhoud van de beken en dijken diverse protocollen. Ook voor de omgang met Jacobskruiskruid is een protocol (pdf) opgesteld. Het werk in het veld wordt uitgevoerd aan de hand van ondermeer dit protocol.
Ook de Limburgse Land- en Tuinbouw Bond (LLTB) heeft een folder (pdf) uitgebracht over de omgang met Jacobskruiskruid.
